自1978年开始培养数学史研究生，2007年开始培养科学技术史博士研究生。毕业生中有一批活跃于科技史界的学科带头人和学术骨干，具有良好的学术声誉。有多篇博士学位论文和硕士学位论文被评选为自治区优秀学位论文。2012年设立科学技术史博士后流动站，入站博士后4人。

科学技术史硕士毕业生150多人，博士毕业生53人(其中留学生8人)。目前有在校硕士生、博士生、留学生共98人。2014年科技哲学专业硕士点转入本院，已招生 6人，毕业1人。

研究院为全校开设科学史、科学哲学等领域的通识课，近几年每年选课人数都超过2000人，取得良好效果。